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研究者紹介

総括班

岩田 想(領域代表者)
清中 茂樹
朴 三用
永野 真吾
南後 恵理子
足立 伸一
山本 雅貴
久保 稔
宮下 治

A01 : 岩田班 光動作タンパク質の時分割構造解析と合理的改変

研究代表者
岩田 想
京都大学 医学研究科 教授
専門:構造生物学
研究役割:光応答性タンパク質の時分割構造解析
http://cell.mfour.med.kyoto-u.ac.jp
研究分担者
野村 紀通
京都大学 医学研究科 准教授
専門:タンパク質工学
研究役割:光応答性タンパク質の作製・機能解析
http://cell.mfour.med.kyoto-u.ac.jp
研究分担者
近藤 美欧
大阪大学 工学研究科 准教授
専門:錯体触媒化学
研究役割:光応答性金属錯体の合成
http://www.chem.eng.osaka-u.ac.jp/masaoka_lab/
研究分担者
草木迫 司
東京大学 理学系研究科 助教
専門:構造生物学
研究役割:光応答性タンパク質の時分割構造解析
http://www.nurekilab.net/

研究協力者

濡木 理
東京大学 理学系研究科 教授
光応答性膜イオンチャネルの時分割構造解析

水野 秀昭
ベルギー・ルーヴェンカトリック大学 (KU Leuven) 教授
フォトクロミック蛍光タンパク質の時分割構造解析

山下 恵太郎
MRC分子生物学研究所 博士研究員

浅田 秀基 
京都大学 医学研究科 特定講師

A01 : 清中班 タンパク質の非平衡状態構造解析を可能にするケミカル光制御法の開発

研究代表者
清中 茂樹
名古屋大学 工学研究科 教授
専門:ケミカルバイオロジー
研究役割:タンパク質の活性制御
http://www.chembio.nagoya-u.ac.jp/labhp/life1/index.html
研究分担者
古田 寿昭
東邦大学 理学部 教授
専門:生体関連化学
研究役割:光作動性ケージド分子の設計と合成
https://www.toho-u.ac.jp/sci/biomol/lab/furuta_lab/index.html
研究分担者
永澤 秀子
岐阜薬科大学 薬化学研究室 教授
専門:創薬化学
研究役割:分子プローブの設計と合成
https://yakka-gifu-pu.jp/

研究協力者

島本 啓子
サントリー生命科学財団 生物有機科学研究所

堂浦 智裕
名古屋大学 工学研究科 助教

A01 : 朴班 光感受性タンパク質の多様な光反応機構解明

研究代表者
朴 三用
横浜市立大学 生命医科学研究科 教授
専門:生物物理学
研究役割:光活性化タンパク質の時分割構造解析
http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/pdl/PDL/JPhome/division.htm
研究分担者
梅名 泰史
名古屋大学 シンクロトロン光研究センター 准教授
専門:構造生物学
研究役割:集光アンテナタンパク質の時分割構造解析
https://profs.provost.nagoya-u.ac.jp/html/100011789_ja.html?k=梅名

研究協力者

別所 義隆
Academia Sinica, Institute of Biological Chemistry(台湾) 客座教授
構造生物学、タンパク質の構造解析

Jeremy R.H.Tame
横浜市立大学 生命医科学研究科 教授
構造生物学、タンパク質の構造解析

水谷 健二
横浜市立大学 生命医科学研究科 助教
分子生物学、タンパク質の精製、結晶化

A01 : 永野班 酵素が巧みに織りなす化学反応過程のダイナミズムの撮像

研究代表者
永野 真吾
鳥取大学 工学研究科 教授
専門:酵素化学
研究役割:研究統括とディールスアルダー酵素反応可視化
http://www.bio.tottori-u.ac.jp/~struct_biol/index.html

研究分担者
中津 亨
和歌山県立医科大学 薬学部 教授
専門:タンパク質結晶学
研究役割:発光タンパク質イクオリンの時分割SFX
https://wmed-phar-bpc.jp/

研究分担者
溝端 栄一
大阪大学 工学研究科 講師
専門:構造生物学
研究役割:Rubiscoの時分割SFX
http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/view?u=2561

B01 : 南後班 時分割実験のための多様な反応誘起システムの開発

研究代表者
南後 恵理子
東北大学 多元物質科学研究所 教授
専門:XFEL構造生物学
研究役割:時分割結晶構造解析の手法開発
http://db.tagen.tohoku.ac.jp/php/forweb/outline.php?lang=ja&no=3111
研究分担者
清水 伸隆
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 教授
専門:生物物理学
研究役割:X線溶液散乱の装置開発、測定解析
https://www2.kek.jp/imss/sbrc/
研究分担者
大和田 成起
高輝度光科学研究センター XFEL利用研究推進室 研究員
専門:レーザー光学
研究役割:試料評価技術開発
http://www.jasri.jp/

研究協力者

登野 健介
高輝度光科学研究センター XFEL利用研究推進室 グループリーダー
X線実験

城地 保昌
高輝度光科学研究センター XFEL利用研究推進室 チームリーダー
データ解析

中根 崇智
大阪大学 蛋白質研究所 特任講師
結晶解析法および単粒子解析法のデータ処理

鈴木 守
大阪大学 蛋白質研究所 准教授
シリアル結晶構造解析

桝田 哲哉
龍谷大学 農学部 教授
シリアル結晶構造解析

上久保 裕生
奈良先端科学技術大学院大学 教授
タンパク質複合系の溶液中動態解析

池口 満徳
横浜市立大学 生命医科学研究科 教授
計算構造生物学

藤原 孝彰
東北大学 多元物質科学研究所 助教

足立 伸一
高エネルギー加速器研究機構 理事

片山 哲夫
高輝度光科学研究センター XFEL利用研究推進室 研究員

野澤 俊介
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 准教授

姜 正敏
理化学研究所 放射光科学総合研究センター ビームライン開発チーム 研究員

B01 : 山本班 動的構造解析に資する固定ターゲット微小結晶解析法の開発

研究代表者
山本 雅貴
理化学研究所 放射光科学研究センター 部門長
専門:放射光構造生物学 
研究役割:微小結晶からの測定技術開発 http://www.riken.jp/research/labs/rsc/adv_photon/life_sci_res_infrastruct/sr_life_sci/
研究分担者
熊坂 崇
高輝度光科学研究センター タンパク質結晶解析推進室 室長
専門:放射光構造生物学
研究役割:室温測定技術
http://www.jasri.jp/

研究協力者

吾郷 日出夫
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員

上野 剛
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任技師

平田 邦生
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任技師

長谷川 和也
高輝度光科学研究センター タンパク質結晶解析推進室 主幹研究員

馬場 清喜
高輝度光科学研究センター タンパク質結晶解析推進室 主幹研究員

松浦滉明
理化学研究所 放射光科学研究センター 特別研究員

C01 : 久保班 時間分解構造解析を補完する精密顕微分光計測

研究代表者
久保 稔
兵庫県立大学 大学院生命理学研究科 教授
専門:生体分子分光学
研究役割:紫外可視吸収/ラマン/赤外分光分析 https://ramanir311.wixsite.com/kubolabo-uoh
研究分担者
木村 哲就
神戸大学 理学研究科 講師
専門:生物物理学
研究役割:蛍光分光分析、二液混合測定技術開発
https://tetsukimura-lab.jp/
研究分担者
古谷 祐詞
名古屋工業大学 大学院工学研究科 准教授
専門:生物物理学
研究役割:赤外分光分析
http://biophys-molsci.web.nitech.ac.jp/index.html

研究協力者

神取 秀樹
名古屋工業大学 大学院工学研究科 教授

河野 能顕
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任技師

水野 操
大阪大学 理学研究科 助教

山田 大智
兵庫県立大学 大学院理学研究科 助教

長尾 聡
兵庫県立大学 大学院理学研究科 特任助教

C01 : 宮下班 分子シミュレーションによるタンパク質化学反応ダイナミクスの解明

研究代表者
宮下 治
理化学研究所 計算科学研究センター 上級研究員
専門:生物物理学
研究役割:ハイブリッドシミュレーション 
https://www.r-ccs.riken.jp/
研究分担者
庄司 光男
筑波大学 計算科学研究センター 助教
専門:理論化学
研究役割:量子古典混合計算 https://www2.ccs.tsukuba.ac.jp/people/mshoji/index.html
研究分担者
篠田 恵子
東京大学 先端科学技術研究センター 特任助教
専門:計算生命科学
http://www.lsbm.org/

研究協力者

高田 彰二
京都大学 理学研究科 教授
生体分子シミュレーション

重田 育照
筑波大学 計算科学研究センター 教授
量子ダイナミクス

Erik Lindahl
Stockholm University, Professor
Biophysics

杉田 有治
理化学研究所 主任研究員
生体分子シミュレーション

TAMA Florence
名古屋大学物理学教室/トランスフォーマティブ生命分子研究所 教授 
理化学研究所計算科学研究センター チームリーダー
ハイブリッドモデリング手法

RAGHAVAN Sriram
理化学研究所計算科学研究センター 特別研究員
XFELデータ解析

宮川晃一
筑波大学計算科学研究センター 研究員
高精度量子化学計算

A01:福田班 中間体構造解析による光感受性膜タンパク質の光エネルギー変換機構の解明 (2022年公募班)  

研究代表者
福田 昌弘  
東京大学大学院 総合文化研究科 先進科学研究機構 特任助教   
専門:構造生物学
http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/hekato_lab/

研究協力者

井上 圭一
東京大学物性研究所 准教授

A01:Campbell班 Next Generation Biosensors Enabled by High-speed Visualization of Dynamic Mechanisms (2022年公募班)  

研究代表者
キャンベル ロバート.アール   
東京大学 大学院理学系研究科 教授    
専門:生体分子化学、光遺伝学、タンパク質工学、ケミカルバイオロジー
https://www.chem.s.u-tokyo.ac.jp/campbell/

研究協力者

寺井 琢也
東京大学大学院理学系研究科 特任准教授

那須 雄介
東京大学大学院理学系研究科 助教

A01:島田班 ケージド中間体を用いた2種のヘム分解酵素の機構解明 (2022年公募班)  

研究代表者
島田 敦広 
岐阜大学 応用生物科学部 准教授 
専門:酵素科学、構造生物学
http://www.abios.gifu-u.ac.jp/sbk/post-2.html

A01:松尾班 光薬理学リガンドを駆使したタンパク質の光機能化 (2022年公募班)  

研究代表者
松尾 和哉
京都工芸繊維大学 分子化学系 助教
専門:ケミカルバイオロジー
http://www.cis.kit.ac.jp/~antisen/seijo.html

A01:山元班 二元機能性青色光受容タンパク質の光応答機構 (2022年公募班) 

研究代表者
山元 淳平
大阪大学 大学院基礎工学研究科 准教授
専門:生物有機化学・光生物学
http://www.chem.es.osaka-u.ac.jp/bio/

A01:島班 光制御型Rasを用いたがん化シグナル伝達機構の原子スケールでの解明 (2022年公募班) 

研究代表者
島 扶美
神戸大学大学院 科学技術イノベーション研究科 教授 
専門:生化学、分子生物学、創薬科学、構造生物学、生理学
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/profile
http://www.lab.kobe-u.ac.jp/stin-dds/staff

研究協力者

槇野 義輝
神戸大学大学院 医学研究科 特命助教  

河村 高志
河村 高志 高輝度光科学研究センター 構造生物学推進室 研究員

松本 篤幸
京都大学大学院 医学研究科 特定准教授  

A01:日野班 高速分子動画でTRPチャネルの温度センサー部位を見極める (2022年公募班) 

研究代表者
日野 智也
鳥取大学 大学院工学研究科 准教授 
専門:膜タンパク質の構造生物学・生物工学
http://www.bio.tottori-u.ac.jp/~struct_biol/

A01:菅班 酸素非発生型の光合成反応中心-アンテナ超複合体の高速分子動画解析 (2022年公募班) 

研究代表者
菅 倫寛
岡山大学 異分野基礎科学研究所 教授   
専門:膜タンパク質の構造生物学
https://sites.google.com/view/sugalab/home

研究協力者

大友 征宇
茨城大学 理工学研究科 教授 

于 龍江
中国科学院 植物研究所 研究員

沈 建仁
岡山大学 異分野基礎科学研究所 教授

A01:村川班 シリアルフェムト秒結晶構造解析に基づく銅含有アミン酸化酵素の触媒機構の解明 (2022年公募班)   

研究代表者
村川 武志
大阪医科薬科大学 医学部 生化学教室 助教    
専門:酵素化学
https://www.ompu.ac.jp/u-deps/med//

A01:下村班 非天然アミノ酸を用いた汎用かつ簡便なタンパク質光感受化法   (2022年公募班) 

研究代表者
下村 拓史
生理学研究所 神経機能素子研究部門 助教 
専門:電気生理学、分子生理学
http://www.nips.ac.jp/biophys/

A01:保坂班 大腸菌無細胞合成系を利用した光反応性非天然型アミノ酸導入タンパク質調製法の開発 (2022年公募班)

研究代表者
保坂 俊彰 
理化学研究所  生命機能科学研究センター 技師         
専門:タンパク質構造解析
https://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/shirouzu-m-protein/index.html

A01:當舎班 金属酵素活性中心による一酸化窒素還元反応の高速分子動画撮影 (2022年公募班) 

研究代表者
當舎 武彦
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員 
専門:生物無機化学
http://www2.riken.jp/biometal/index.htm

B01:鈴木班 散漫X線散乱による動的構造解析に向けた高感度計測システムの実現 (2022年公募班)

研究代表者
鈴木 明大
北海道大学 電子科学研究所 助教
専門:X線イメージング
http://cxo-www.es.hokudai.ac.jp/ja/index.html

研究協力者

山崎 憲慈
北海道大学 工学研究院 助教

B01: Basudev班 Direct visualization of the excited state structural dynamics of a synthetic Cu(I)-phenanthroline complex by TR-SFX method (2022年公募班)

研究代表者
Maity Basudev
東京工業大学 生命理工学院 助教 
専門:Artificial metalloproteins; Protein engineering; Coordination chemistry; High-speed AFM; Protein dynamics and Molecular movies
http://www.ueno.bio.titech.ac.jp/en/index.html

C01:北尾班 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析 (2022年公募班) 

研究代表者
北尾 彰朗 
東京工業大学 生命理工学院 教授  
専門:計算生物学,生物物理学,理論化学
http://www.kitao.bio.titech.ac.jp/

C01:林班 ハイブリッド自由エネルギー最適化法によるタンパク質機能活性化の理論的解明 (2022年公募班) 

研究代表者
林 重彦
京都大学 理学研究科 教授 
専門:理論化学
http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/riron/index.html

C01:小野班 高速分子動画と大規模励起状態分子動力学の共創が拓く光生命化学現象の解明 (2020年公募班) 

研究代表者
小野 純一
早稲田大学 理工学術院総合研究所 次席研究員  
専門:理論化学,計算分子科学
http://www.chem.waseda.ac.jp/nakai/

C01:片山班 フェムト秒顕微過渡吸収測定法によるたんぱく質微結晶の非破壊計測とその機構解明 (2022年公募班)  

研究代表者
片山 哲郎  
徳島大学 ポストLEDフォトニクス研究所 助教 
専門:物理化学、光化学、顕微超高速分光
https://www.pled.tokushima-u.ac.jp/research/members/234/

C01:光武班 分子シミュレーションを駆使したオレキシン受容体の機能機構の解明 (2022年公募班)  

研究代表者
光武 亜代理    
明治大学 理工学部 准教授    
専門:生物物理学、計算物理学、分子シミュレーション
https://www.biophys1st-lab-meiji.org/

研究協力者

丸山 豊 
明治大学 客員研究員

C01:八木班 非断熱QM/MM分子動力学計算による光駆動タンパク質の反応ダイナミクス (2022年公募班)  

研究代表者
八木 清    
理化学研究所 開拓研究本部 杉田理論分子科学研究室 専任研究員     
専門:計算化学、分子振動理論
https://tms.riken.jp/

研究協力者

武次 徹也
北海道大学 理学研究院・WPI-ICReDD 教授 

A01:松尾班 タンパク質のリガンド結合・解離過程の高速分子動画 (2020年公募班)  

研究代表者
松尾 和哉
京都工芸繊維大学 分子化学系 助教

A01:松井班 ケージド中間体を用いた2種のヘム分解酵素の機構解明 (2020年公募班)  

研究代表者
松井 敏高 
東北大学 多元物質科学研究所 准教授

A01:志甫谷班 XFELを用いた非古典的ロドプシンのダイナミクスの解明 (2020年公募班)  

研究代表者
志甫谷 渉  
東京大学 大学院理学系研究科 特任助教 

A01:片山班 明暗視をもたらす動物ロドプシンの構造ダイナミクスの解明 (2020年公募班) 

研究代表者
片山 耕大 
名古屋工業大学 大学院工学研究科 助教

A01:山元班 (6-4)光回復酵素によるDNA修復過程の分子動画撮影 (2020年公募班) 

研究代表者
山元 淳平
大阪大学 大学院基礎工学研究科 准教授

A01:日野班 高速分子動画撮影によるTRPチャネルの熱刺激応答機構の解明 (2020年公募班) 

研究代表者
日野 智也
鳥取大学 大学院工学研究科 准教授 

A01:菅班 光合成反応中心とアンテナ複合体の超複合体の高速分子動画解析 (2020年公募班) 

研究代表者
菅 倫寛
岡山大学 異分野基礎科学研究所 准教授  

A01:村川班 シリアルフェムト秒結晶構造解析による銅含有アミン酸化酵素の触媒機構の解明 (2020年公募班)   

研究代表者
村川 武志
大阪医科大学 医学部 生化学教室 助教  

A01:下村班 光異性化アミノ酸導入による、リガンド依存性イオンチャネルの光制御化法の開発 (2020年公募班) 

研究代表者
下村 拓史
生理学研究所 神経機能素子研究部門 助教 

A01:保坂班 大腸菌無細胞合成系を利用した時分割SFX実験に適したサンプル調製法の開発 (2020年公募班)

研究代表者
保坂 俊彰 
理化学研究所  生命機能科学研究センター 研究員   

A01:當舎班 高速分子動画でみる金属酵素活性中心におけるNO還元反応 (2020年公募班) 

研究代表者
當舎 武彦
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員 

A01:島班 caged-GTPを用いた低分子量G蛋白質のシグナル伝達過程の時分割構造解析 (2020年公募班) 

研究代表者
島 扶美
神戸大学大学院 科学技術イノベーション研究科 教授 

B01:鈴木班 高感度動的結晶構造解析のための超低バックグラウンド試料セル (2020年公募班)

研究代表者
鈴木 明大
北海道大学 電子科学研究所 助教

B01: Basudev班 Time-resolved serial crystallography for dynamic observation of non-enzymatic reactions promoted inside crystalline protein scaffold (2020年公募班)

研究代表者
Maity Basudev
東京工業大学 生命理工学院 助教 

C01:田中班 光をトリガとしない高速酵素反応機構解明 (2020年公募班)  

研究代表者
田中 伊知朗
茨城大学 大学院理工学研究科 教授 

C01:北尾班 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析 (2020年公募班) 

研究代表者
北尾 彰朗 
東京工業大学 生命理工学院 教授 

C01:林班 ハイブリッド自由エネルギー最適化法によるタンパク質機能活性化の理論的解明 (2020年公募班) 

研究代表者
林 重彦
京都大学 理学研究科 教授 

C01:小野班 分子動画に基づく大規模量子分子動力学法による生体内プロトン輸送機構の解明 (2020年公募班) 

研究代表者
小野 純一
京都大学 学際融合教育研究推進センター 特定研究員<

C01:杉本班 ヘム酵素が生成する酸化活性種の精密構造解析 (2020年公募班)    

研究代表者
杉本 宏 
理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員

C01:櫻庭班 タンパク質の大きな構造変化をさっと出す (2020年公募班) 

研究代表者
櫻庭 俊 
量子科学技術研究開発機構 量子生命科学領域 主任研究員